Prospecção e caracterização in silico de RNAS longos não codificantes (incRNAs) em dados públicos de transcriptomas de fungos patogênicos humanos
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Date
2023
Authors
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Publisher
Universidade de Mogi das Cruzes
Abstract
O presente projeto tem como objetivo a prospecção e caracterização in silico de RNAs longos não codificantes (lncRNAs) em dados públicos de transcriptomas de 15 espécies de fungos patogênicos humanos. A compreensão da regulação gênica em fungos patogênicos é crucial para o desenvolvimento de terapias eficazes, e os lncRNAs são uma classe emergente de moléculas reguladoras cuja função é ainda pouco compreendida nestes organismos. Para alcançar este objetivo, os dados de transcriptoma foram obtidos através do Transcriptome Shotgun Assembly Sequence Database (TSA) e submetidos a diversas ferramentas de bioinformática para avaliar o potencial codificador dos transcritos e anotá-los funcionalmente. Este projeto resultou na identificação de 29.746 lncRNAs em 15 espécies de fungos patogênicos humanos, muitos dos quais ainda não haviam sido caracterizados previamente. Estes dados fornecem uma base valiosa para futuras investigações sobre a regulação gênica em fungos patogênicos e podem ser utilizados para o desenvolvimento de novas terapias para infecções fúngicas. Além disso, a disponibilidade de dados públicos foi essencial para a realização deste projeto e contribuiu para a construção de novos conhecimentos na área da micologia clínica.
Description
Keywords
RNA longo não codificante, Transcriptoma, Fungos
Citation
SIMEONE, Alexandre Santos. Prospecção e caracterização in silico de RNAS longos não codificantes (incRNAs) em dados públicos de transcriptomas de fungos patogênicos humanos. 2023. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Mogi das Cruzes, 2023.